目前大多自来水厂普遍采用沉淀过滤、加氯消毒的传统处理工艺。
氯是一种强氧化剂，是国际上广泛使用的自来水消毒剂。按国际要求，余氯的安全量为管网末梢(家庭自来水龙头处)应保持在0.05毫克/升水，以控制细菌在输送过程的滋生，所以市供自来水都含有余氯。
余氯受热后与水中有机腐质产生三氯甲烷等致癌物质。研究者发现，长期饮用含余氯超标的水可能会导致心脏疾病、冠状动脉粥样硬化、贫血症、甚至癌症、高血压和过敏等症状。
城市很多小区小高层的供水采用楼顶水箱从最顶层向下供水，由于对水箱的管理不善，使水箱中滋生大量的病菌、蓝藻、绿藻等，导致自来水出现铁锈、红虫、浑浊、水垢、异味等，使家庭饮用水水质不达标。
